Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms