Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cep55Q8BT07 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cep55Q8BT07 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cep55Q8BT07 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cep55Q8BT07 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cep55Q8BT07 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cep55Q8BT07 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Cep55Q8BT07 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cep55Q8BT07 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms