Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pbrm1Q8BSQ9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms