Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQU3

Sdhaf3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdhaf3Q8BQU3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms