Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc2Q8BKV1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms