Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prox2Q8BII1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prox2Q8BII1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms