Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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