Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt12Q8BG71 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms