Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpped1Q8BFS6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms