Protein–RNA interactions for Protein: Q811S7

Ubp1, Upstream-binding protein 1, mousemouse

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1Q811S7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ubp1Q811S7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ubp1Q811S7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ubp1Q811S7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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