Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfascQ810U3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms