Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms