Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Lrrc27Q80YS5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Lrrc27Q80YS5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Lrrc27Q80YS5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Lrrc27Q80YS5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Lrrc27Q80YS5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Lrrc27Q80YS5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms