Protein–RNA interactions for Protein: Q80X53

Ccdc116, Coiled-coil domain-containing protein 116, mousemouse

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Length 541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc116Q80X53 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ccdc116Q80X53 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ccdc116Q80X53 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ccdc116Q80X53 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ccdc116Q80X53 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc116Q80X53 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc116Q80X53 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc116Q80X53 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc116Q80X53 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc116Q80X53 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc116Q80X53 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc116Q80X53 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc116Q80X53 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc116Q80X53 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc116Q80X53 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc116Q80X53 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc116Q80X53 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc116Q80X53 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc116Q80X53 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc116Q80X53 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc116Q80X53 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc116Q80X53 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc116Q80X53 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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