Protein–RNA interactions for Protein: Q80W04

Tmcc2, Transmembrane and coiled-coil domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc2Q80W04 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmcc2Q80W04 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms