Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc1Q80VQ1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms