Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnma8aQ80VM8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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