Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ttc29Q80VM3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ttc29Q80VM3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ttc29Q80VM3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ttc29Q80VM3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ttc29Q80VM3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ttc29Q80VM3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Ttc29Q80VM3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ttc29Q80VM3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ttc29Q80VM3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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