Protein–RNA interactions for Protein: Q80US4

Actr5, Actin-related protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr5Q80US4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actr5Q80US4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Actr5Q80US4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Actr5Q80US4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Actr5Q80US4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Actr5Q80US4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Actr5Q80US4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actr5Q80US4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actr5Q80US4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actr5Q80US4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actr5Q80US4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actr5Q80US4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actr5Q80US4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actr5Q80US4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actr5Q80US4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actr5Q80US4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actr5Q80US4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms