Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rexo1Q7TT28 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rexo1Q7TT28 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rexo1Q7TT28 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rexo1Q7TT28 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rexo1Q7TT28 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rexo1Q7TT28 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rexo1Q7TT28 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rexo1Q7TT28 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Rexo1Q7TT28 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms