Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec18aQ7TSQ1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec18aQ7TSQ1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms