Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 289.7 ms