Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actn1Q7TPR4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms