Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms