Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD6

Raver2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver2Q7TPD6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Raver2Q7TPD6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Raver2Q7TPD6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms