Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp397Q7TNK4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp397Q7TNK4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms