Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shq1Q7TMX5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
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