Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcg2Q7TMS5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcg2Q7TMS5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcg2Q7TMS5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcg2Q7TMS5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcg2Q7TMS5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcg2Q7TMS5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcg2Q7TMS5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcg2Q7TMS5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcg2Q7TMS5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcg2Q7TMS5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcg2Q7TMS5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcg2Q7TMS5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms