Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SyncripQ7TMK9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms