Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Scn4bQ7M729 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Scn4bQ7M729 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Scn4bQ7M729 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Scn4bQ7M729 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Scn4bQ7M729 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Scn4bQ7M729 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Scn4bQ7M729 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Scn4bQ7M729 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Scn4bQ7M729 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Scn4bQ7M729 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Scn4bQ7M729 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Scn4bQ7M729 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Scn4bQ7M729 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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