Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sox11Q7M6Y2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms