Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Trappc6aQ78XR0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Trappc6aQ78XR0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Trappc6aQ78XR0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Trappc6aQ78XR0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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