Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn5Q6VZZ7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Opn5Q6VZZ7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn5Q6VZZ7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn5Q6VZZ7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn5Q6VZZ7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn5Q6VZZ7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn5Q6VZZ7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn5Q6VZZ7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn5Q6VZZ7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn5Q6VZZ7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn5Q6VZZ7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms