Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms