Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn2Q6PHP6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrn2Q6PHP6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms