Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms