Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms