Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtifQ6PEE2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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