Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbtb40Q6PCS8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbtb40Q6PCS8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbtb40Q6PCS8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbtb40Q6PCS8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Zbtb40Q6PCS8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbtb40Q6PCS8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbtb40Q6PCS8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbtb40Q6PCS8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbtb40Q6PCS8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbtb40Q6PCS8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbtb40Q6PCS8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Zbtb40Q6PCS8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Zbtb40Q6PCS8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbtb40Q6PCS8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbtb40Q6PCS8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbtb40Q6PCS8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Zbtb40Q6PCS8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbtb40Q6PCS8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Zbtb40Q6PCS8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Zbtb40Q6PCS8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbtb40Q6PCS8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbtb40Q6PCS8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbtb40Q6PCS8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbtb40Q6PCS8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbtb40Q6PCS8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbtb40Q6PCS8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Zbtb40Q6PCS8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Zbtb40Q6PCS8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Zbtb40Q6PCS8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Zbtb40Q6PCS8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Zbtb40Q6PCS8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbtb40Q6PCS8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Zbtb40Q6PCS8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Zbtb40Q6PCS8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Zbtb40Q6PCS8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Zbtb40Q6PCS8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Zbtb40Q6PCS8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms