Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB75

Papd7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd7Q6PB75 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd7Q6PB75 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms