Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAI4

Lce3f, Late cornified envelope 3F, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce3fQ6PAI4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Lce3fQ6PAI4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms