Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms