Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W0

Senp6, Sentrin-specific protease 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp6Q6P7W0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Senp6Q6P7W0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms