Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Podnl1Q6P3Y9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms