Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A1

Stmnd1, Stathmin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmnd1Q6P3A1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stmnd1Q6P3A1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stmnd1Q6P3A1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stmnd1Q6P3A1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms