Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paxip1Q6NZQ4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms