Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms