Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpsf6Q6NVF9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpsf6Q6NVF9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms