Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sohlh1Q6IUP1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms