Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms